细菌分子鉴定

细菌16S rDNA分子鉴定及全序列解析

细菌的rDNA有5S，16S，23S三种。其中5S rDNA信息量少，不适合分析，而23S rDNA分子量大，但碱基突变速率要比16S rDNA快得多，对于较远的亲缘关系不适用。16S rDNA其大小在1,500 bp左右，所代表的信息量适中，因此是进行分类研究的理想材料。

细菌多位点分子鉴定及全序列解析

根据用户的需求，为了提供高质量、更为精准的鉴定服务，我们也采用国际流行的多位点基因序列鉴定方法，候选的基因包括gyrB、recA、rpoB等。

服务内容：

扩增细菌16S rDNA的全长序列，约1,500 bp左右，进行三个测序反应，以得到较为全面的种属特异性信息。

得到信息后，进行生物信息学比对，以确定细菌的种类，多数情况下可以精确到种，少数情况下也可以定位到属。

服务说明：

1. 我们目前接收的样品形式为：基因组DNA、经菌种分离后带有单菌落的新鲜平板或斜面。由于平板和斜面以外的其它形式样品实验成功率较低，所以我们暂不接收这样的样品。
2. 基因组DNA的浓度≥10 ng/μl，总体积≥20 μl，且无明显降解。平板或斜面应长有分离纯化的单菌落。
3. 由于革兰氏阳性细菌的细胞壁较厚，采用试剂盒常规方法较难破壁，建议您提供基因组DNA(为了保证扩增质量，建议您提取后做一次乙醇沉淀以去除残存的盐离子等可能抑制PCR反应的成分)。
4. 对于特殊菌株(如厌氧菌、放线菌等)，请在服务委托书中加以说明。
5. 常温运输时间过长会导致菌体老化，细胞壁难以破碎，因此对于平板或斜面，建议您使用冰袋运输。